Iedere mediation vindt plaats op grond van een overeenkomst. Het is verstandig om de concrete afspraken die zullen gelden gedurende het mediationproces in een schriftelijke vorm vast te leggen. Een dergelijk overeenkomst wordt een mediationovereenkomst genoemd. In de overeenkomst worden de spelregels opgenomen waarover de partijen en hun mediator van te voren duidelijke afspraken moeten maken. Het welslagen van mediation hangt voor een belangrijk deel af van duidelijke afspraken tussen de partijen en de mediator.

Een mediationovereenkomst houdt een inspanningsverplichting in om het geschil door middel van mediation op te lossen. De overeenkomst bevat onder meer een duidelijke omschrijving van het geschil, de bevoegdheid van partijen om bindende afspraken te maken en het definitief overeenkomen van een eventueel vergelijk in een vaststellingovereenkomst. Voorts bevat de overeenkomst onderwerpen als het vertrouwelijk karakter van de mediation en de geheimhouding door alle partijen van alles wat tijdens de mediation ter sprake komt. Verder is het van belang om duidelijk op te nemen dat elke partij de bevoegdheid heeft het onderhandelingsproces te verlaten indien men in voortzetting geen vertrouwen meer heeft, zonder op enigerwijze gebonden te zijn aan ingenomen standpunten of gedane voorstellen.